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A coloração PAS é usada principalmente para a coloração de estruturas que contenham uma alta proporção de carboidratos, como glicogênio, glicoproteínas, proteoglicanos, geralmente encontrados em tecidos conjuntivos, muco e membranas basais.
São geralmente usadas para a coloração de biópsias de rim, de fígado, certas glicogenoses em músculos estriados e suspeitas de infecções fúngicas.
