Le bleu alcian est généralement préparé à un pH acide de 2,5 et est utilisé pour la mise en évidence des mucopolysaccharides acides et des mucines acides.
Des quantités excessives de mucosubstances acides non sulfatées sont observées dans les mésothéliomes. Elles se trouvent aussi normalement dans les parois des vaisseaux sanguins mais leur quantité augmente dans les lésions précoces d'athérosclérose.